高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
检测过程:
1.样本准备(sample fragmentation)
2.文库构建(library preparation)
3.测序反应(sequencing reaction)
本平台提供的服务:
转录组测序
又称RNA-seq,转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的mRNA,通过新一代高通量测序,能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息。
Small RNA测序
小RNA是一类重要的体内调节分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。小RNA测序技术采用胶分离技术,收集样品中18-30nt的RNA片段,利用高通量测序技术,一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息,依托强大的生物信息分析平台,鉴定已知小RNA,并预测新的小RNA及其靶标基因。
LncRNA测序
lncRNA(长链非编码RNA,long non-coding RNA,lncRNA)测序也称为全转录组测序,与普通的通过polyA富集方法的转录组测序不同的是,lncRNA测序是通过rRNA去除法从而对含有polyA尾和不含有polyA尾的RNA一同富集建库测序。
circRNA测序
环状RNA(circRNA)是一类特殊的非编码RNA分子,呈封闭环状结构,不受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解。由于circRNA的闭合环状特性,通过去除total RNA中的rRNA和线性RNA分子,可以特异地富集circRNA分子后测序,更有针对性地分析受检样本中特定的circRNA谱、circRNA剪接模式、组间差异和功能等。
基因组重测序
人全基因组重测序是基于人基因组参考序列对个体或群体进行全基因组测序,并在个体或群体水平进行生物信息分析,从而进行个体或群体的基因组的差异性。
宏基因组测序
宏基因组学(Metagenomics)又叫微生物环境基因组学、元基因组学。它通过直接从环境样品中提取全部微生物的DNA,构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究环境样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能。
16s/18s/ITS测序
16S/18S/ITS等扩增子测序,也称微生物多样性测序,即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的某一或某几个区,通过检测目的区域的序列变异和丰度,对环境样本物种分类及丰度,种群结构,系统进化,群落比较等方面信息进行分析的研究方法。16S rDNA是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”,真菌可以采用18S rDNA测序的方法进行菌种鉴定。
美轩优势
●
极强地处理复杂样本的能力
● 丰富的建库经验,加入文库均一化技术
● 最佳的测序解决方案和快速的分析平台
● 全面和高质量的基因解析结果
拥有多种测序平台和强大的计算机资源,提供最佳的测序解决方案和快速的分析平台;
拥有专业的分析团队,全面的分析内容,提供全面和高质量的基因组解析结果;
客户提供
样本,要求如下:
样品类型 |
样品要求 |
血液 |
2ml(DNA)-5ml(RNA)以上新鲜或冻存的抗凝血,或从全血中提取的白细胞,推荐使用EDTA抗凝剂,不要使用肝素抗凝 |
组织 |
动物组织500mg(RNA)-1g(DNA)以上,植物组织2g以上 |
细胞 |
1*107个以上 |
16s/18s测序 |
常规样本2g以上沉淀,水样10ml以上,根据微生物丰度 |
宏基因组 |
常规样本5g以上沉淀,水样25ml以上,根据微生物丰度 |
做DNA方面,需冰袋运输;做RNA方面,样本中需加trizol,干冰运输。
美轩提供
1、完整详尽的实验报告;
2、实验中所涉及的图片、数据;
3、实验结果分析。